Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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