Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPTFQ12830 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPTFQ12830 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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