Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFCP2Q12800 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms