Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP6Q0PNE2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP6Q0PNE2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms