Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP4Q09028 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms