Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DMPKQ09013 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms