Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms