Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG1Q06432 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms