Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms