Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCNT1Q02742 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms