Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TTTY25P-201ENST00000558356 1505 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL138831.3-201ENST00000623656 1458 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC027369.1-202ENST00000534734 1330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms