Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU5F1Q01860 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU5F1Q01860 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms