Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HOXC5Q00444 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms