Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms