Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS3AP61247 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS3AP61247 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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