Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC4P56524 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms