Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA8P53708 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2052.9 ms