Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSOP43234 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms