Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR1BP42025 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms