Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms