Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3AP31941 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3AP31941 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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