Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms