Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM5AP29375 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms