Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XPAP23025 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XPAP23025 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XPAP23025 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XPAP23025 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
XPAP23025 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XPAP23025 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms