Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF1P22415 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF1P22415 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF1P22415 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF1P22415 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF1P22415 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF1P22415 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF1P22415 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USF1P22415 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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