Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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