Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBTFP17480 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms