Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GJA1P17302 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms