Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms