Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F5P12259 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F5P12259 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F5P12259 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms