Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM10L2BP0DMW5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms