Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms