Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZBED1O96006 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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