Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKAB2O43741 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms