Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA2O43364 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms