Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms