Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USP9YO00507 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9YO00507 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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USP9YO00507 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
USP9YO00507 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
USP9YO00507 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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