Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CLDN25C9JDP6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms