Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms