Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSDA5PKW4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms