Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms