Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms