Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms