Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms