Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX7Q9UNH6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX7Q9UNH6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms