Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms