Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DNAJB4Q9UDY4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms