Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LHX3Q9UBR4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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