Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms