Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DNAJC17Q9NVM6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms